In een schooljaar runnen leerlingen, onder leiding van een docent, een eigen onderneming. In de junior company werken ze met echte producten, echt geld en doen zaken met echte leveranciers en afnemers. De leerlingen kiezen zelf een product of dienst of ze kopen een product in en verkopen dat vervolgens. Als ze inkopen, kan dat bij een groothandel waarmee Jong Ondernemen afspraken heeft. Zo kunnen ze kleine hoeveelheden inkopen tegen groothandelsprijzen.

Echt ondernemen
Junior companies staan niet ingeschreven in het handelsregister van de Kamer van Koophandel, maar in het register van Jong Ondernemen. Dat is ook het enige onderscheid ten opzichte van 'echte' ondernemingen. De leerlingen die meedoen, gaan een product aanbieden waar een markt voor is, een ondernemingsplan schrijven, de inkoop, productie, marktbewerking en verkoop regelen.

Geen risico
Omdat de leerlingen in de junior company geen lonen krijgen, is er bijna altijd winst. Deze winst gaat naar een goed doel. Als er door de klas geen winst wordt gemaakt, betaalt Jong Ondernemen (het restant van) de rekening. Ook is er voor de junior companies een aansprakelijkheids- en rechtsbijstandverzekering afgesloten. De school loopt dus geen risico. Het programma wordt gratis aangeboden aan de scholen.